Tyrėjai nustato visų galimų pagrindinių vėžio geno pokyčių poveikį

Tyrėjai nustato visų galimų pagrindinių vėžio geno pokyčių poveikį

Gyvensena mityba, dietos, judėjimas

Franciso Cricko instituto tyrėjai sudarė visas galimas naviko slopinimo geno, vadinamo VHL, pokyčių pasekmes, o tai yra pirmasis didžiulio tyrimo žingsnis siekiant atskleisti dešimčių tūkstančių su vėžiu susijusių genų genetinių variacijų rezultatus.

Šis VHL žemėlapis gali padėti gydytojams išsiaiškinti, kuriems pacientams gresia inkstų vėžys arba kurie pacientai gali reaguoti į tam tikrus vaistus.

Genetiniai pokyčiai arba variantai įvyksta, kai pakeičiamas vienas ar keli DNR blokai. Tiek įgyti, tiek paveldėti VHL geno variantai gali padidinti inkstų vėžio riziką. Tačiau daugeliui žmonių VHL diagnozuojami „nežinomos reikšmės variantai“ ir jie nežino, ką tai reiškia jų vėžio rizikai.

Šiandien paskelbtame tyrime Gamtos genetikaCrick tyrėjai naudojo naują metodą, vadinamą prisotinimo genomo redagavimu, kad galėtų stebėti daugiau nei 2000 skirtingų VHL variantų žmogaus ląstelėse laikui bėgant.

Jie išmatavo, kiek ląstelių išgyveno su kiekvienu VHL variantu, kuriam vėliau buvo suteiktas „funkcijos balas“: kuo mažesnis balas, tuo variantas kenksmingesnis.

Dauguma analizuotų VHL variantų neturėjo įtakos ląstelių išlikimui, o tai rodo, kad žmonėms, turintiems šiuos variantus, rizika gali būti žymiai didesnė. Tačiau pirmą kartą buvo įrodyta, kad kiti variantai yra klaidingi, o tai reiškia, kad pacientams, sergantiems šiais variantais, dabar gali būti pasiūlyta reguliari patikra, siekiant sumažinti vėžio riziką.

Žalingiausi variantai sukėlė ląstelių mirtį. Komanda nustatė, kad sugedęs VHL genas padidino kito geno, vadinamo HIF, aktyvumą. Šis genas reikalingas ląstelėms padėti išgyventi esant mažai deguonies, tačiau per didelis HIF baltymų kiekis gali sukelti navikus.

Pašalinus HIF iš ląstelių su šiomis VHL mutacijomis, ląstelės išliko gyvos, o tai rodo, kad neigiamas VHL poveikis priklauso nuo HIF.

Belzutifanas, vaistas, slopinantis HIF baltymą, veikia tik žmonėms, turintiems mutacijų, turinčių įtakos HIF kiekiui ląstelėse. Crick komandos sukurta balų sistema galėtų nustatyti žmones, turinčius VHL mutacijų, kuriems būtų naudingas gydymas belzutifanu.

Galiausiai mokslininkai palygino savo balų sistemą su viešai prieinamomis inkstų vėžio duomenų bazėmis ir nustatė, kad jų metodas gali 100% tiksliai numatyti vėžį sukeliančius variantus, anksčiau klinikoje nustatytus.

Gregas Findlay, Crick genomo funkcijų laboratorijos grupės vadovas, sakė: „Daugeliui žmonių sakoma, kad jie turi „nežinomos reikšmės variantą“ VHL gene, ir jie nežino, ką tai reiškia jų vėžio rizikai. Mūsų varianto funkcijos balas gali būti kliniškai naudingas pacientų skirstymo į kategorijas.

„Tiesą sakant, mes parodome, kad pacientai, kurių VHL variantai yra mažiausi, dažniausiai serga inkstų vėžiu. Dabar stengiamės pritaikyti šį metodą daugiau genų, kad šis diagnostikos tikslumo lygis pasiektų daugiau žmonių.”

Megan Buckley, pirmoji autorė ir dabartinė mokslų daktarė. Kembridžo universiteto studentas sakė: „Pakoreguodami prisotinimo genomo redagavimo metodą, parodėme, kad gana paprastas testas gali nustatyti, ką skirtingos VHL mutacijos daro žmogaus ląstelėse.

„Nuostabu, kad daugelis variantų, kurie gali būti susiję su vėžiu, šiame teste turėjo neutralius balus, o tai rodo, kad balų sistema gali suteikti aiškumo pacientams, esantiems nežinioje, ką reiškia jų VHL diagnozė.

Laboratorija dabar bendradarbiauja su Crick Cancer Dynamics Laboratory, siekdama stebėti, kaip funkcijos balas gali numatyti naviko augimą ir atsaką į gydymą pacientams, turintiems VHL mutacijų. Jie taip pat bendradarbiauja su Wellcome Sanger institutu ir Vėžio tyrimų institutu Londone, kad nustatytų visus 15 kitų vėžio rizikos genų variantų efektus.