Hiustono metodistų tyrimų instituto infekcinių ligų tyrėjų komanda, tirianti neseniai atsiradusią bakterijų padermę, vadinamą Streptococcus dysgalactiae porūšiu equisimilis (SDSE). SDSE užkrečia žmones per odą, gerklę, virškinamąjį traktą ir moterų lytinius organus, kad sukeltų įvairių sunkumo infekcijų – nuo streptokokinio gerklės (faringito) iki nekrozinio fascito (mėsą valgančios ligos).
Glaudžiai susijęs su A grupės streptokoku (taip pat žinomas kaip Streptococcus pyogenes), kuris buvo labai gerai ištirtas, mažai žinoma apie SDSE.
Šio tyrimo išvados aprašytos žurnale spalio 17 d. paskelbtame dokumente „Integratyvi genominė, virulentiškumo ir transkriptominė analizė atsirandančių Streptococcus dysgalactiae porūšių equisimilis (SDSE) emm tipo stG62647 izoliatų, sukeliančių žmonių infekcijas“. mBiokurį išleido Amerikos mikrobiologijos draugija kartu su Amerikos mikrobiologijos akademija. Jamesas M. Musseris, MD, Ph.D., Hiustono metodistų patologijos ir genominės medicinos katedros pirmininkas, yra atitinkamas šio straipsnio autorius.
„Atsižvelgiant į tai, kad ji labai svarbi žmonių sveikatai, mūsų ribotas supratimas apie SDSE molekulinę patogenezę yra nepaprastas“, – sakė Jesus M. Eraso, Ph.D., patologijos ir genominės medicinos profesoriaus asistentas su Hiustono metodistu ir pagrindinis tyrimo autorius. .
Siekdama užpildyti šią žinių spragą, Hiustono metodistų komanda taikė sudėtingą integruotą metodą, kad ištirtų 120 tam tikro SDSE potipio, vadinamo stG62647, žmogaus izoliatų. Jie išanalizavo potipio genomą, kuriame saugoma jo DNR informacija, jo transkriptą, kuris pateikia viso geno ekspresijos profilio momentinį vaizdą tuo metu, kai buvo surinktos SDSE ląstelės, ir jo virulentiškumą, kuris nurodo jo daromos žalos laipsnį. jo šeimininkui. StG62647 SDSE padermes svarbu ištirti, nes buvo pranešta, kad jos sukelia neįprastai sunkias infekcijas, o supratimas apie šių trijų subjektų ryšius ir sąveiką tyrėjams padėjo geriau suprasti, kaip tai sukelia ligas.
Šios integracinės analizės duomenys suteikė daug naujų duomenų apie šį svarbų besiformuojantį žmogaus bakterinį patogeną ir yra naudingi atliekant vakcinų tyrimus. Tai taip pat iškėlė daug naujų klausimų ir sukūrė naujų hipotezių, kurias reikia ištirti atliekant šį tęstinį tyrimą.
Musserio ir Eraso bendradarbiai šiame tyrime buvo Randall J. Olsen, S. Wesley Long ir Ryan Gadd iš Hiustono metodistų tyrimų instituto Infekcinių ligų centro ir Sarrah Boukthir, Ahmad Faili ir Samer Kayal iš Rennes universiteto Prancūzijoje.