Tyrėjai sukūrė galingą įrankį, galintį aptikti SARS-COV-2 variantus, turinčius didelį perdavimo potencialą, prieš pradėdami plačiai paplituoti. Šis požiūris galėtų žymiai patvirtinti visuomenės sveikatos pastangas kontroliuoti protrūkius ir padėti nustatyti naujus variantus, kuriuos reikia atidžiau stebėti.
Išanalizavus milijonus virusinių genomo sekų iš viso pasaulio, mokslininkų komanda, vadovaujama Peterio Doherty infekcijos ir imuniteto instituto (Doherty instituto) ir Pitsburgo universiteto, atskleidė specifines mutacijas, kurios suteikia SARS-COV-2 a “. „Turbo Boost“ gebėjimas plisti.
„Tarp tūkstančių SARS-COV-2 mutacijų mes nustatėme nedidelį skaičių, kuris padidina viruso gebėjimą plisti“,-teigė profesorius Matthew McKay, „Doherty“ instituto laboratorijos vadovas ir būsimos ARC bendradarbis Elektros ir elektroninės inžinerijos katedroje Melburno universitete ir bendras tyrimo autorius, išleistas Gamtos ryšiai.
Daugelis šių pagrindinių mutacijų yra smaigalyje baltymuose, kurie padeda virusui patekti į žmogaus ląsteles ir yra antikūnų taikinys. Tačiau komanda taip pat rado svarbių mutacijų kitose, mažiau ištirtose viruso dalyse, kurios sustiprina jo gebėjimą jungtis su žmogaus ląstelėmis, išvengti imuninės sistemos arba pakeisti baltymų struktūrą.
„Mūsų požiūris yra matematiškai paprastas, tačiau labai efektyvus“, – pridūrė profesorius McKay. „Skirtingai nuo ankstesnių metodų, mūsų modelis panaudoja genomo stebėjimo duomenis, kad tiksliai nustatytų tikslias mutacijas, skatinančias tam tikrų variantų plitimą, net kai jie atsiranda tik nedidelėje dalyje.”
Nors šis naujas modelis yra skirtas tik SARS-COV-2, tyrėjai mano, kad jis gali būti pritaikytas tiriant kitų patogenų, tokių kaip gripas, perdavimą.
„Tai yra viena iš pirmųjų praktinių priemonių, skirtų sistemingai kiekybiškai įvertinti, kaip individualios mutacijos daro įtaką viruso perdavimui pasauliniu mastu“,-sakė docentas Johnas Bartonas iš Pitsburgo universiteto, bendro tyrimo autorius.
„Mūsų metodas yra tarsi didinamasis stiklas viruso evoliucijai, padedant visuomenės sveikatos sistemoms pastebėti ir stebėti labai perduodamus variantus, kol jie tampa plačiai paplitę.
„Mes ne tik galime efektyviau sekti SARS-COV-2, bet ir mūsų metodą galima pritaikyti tiriant kitų patogenų raidą, padedant mums išlikti prieš ateities protrūkius. Tai yra galinga priemonė visuotinėms pastangoms kovoti su kylančiomis ligomis.”