Pacientams, sergantiems bakterinėmis infekcijomis, kuo anksčiau jie bus gydomi tinkamais antibiotikais, tuo geriau jiems seksis. Dabartiniai metodai, skirti nustatyti, kurie vaistai gali būti naudingi kiekvienam pacientui, priklauso nuo bakterijų dauginimosi iš paciento laboratorijoje ir užtrunka kelias dienas, kol gaunami rezultatai. Tuo tarpu pacientams dažnai skiriami plataus spektro antibiotikai, kurie skatina vaistams atsparias infekcijas, o tai yra didelė grėsmė visuomenės sveikatai.
Novatoriškas diagnostikos metodas, sukurtas Plačiojo MIT instituto ir Harvardo bei Masačusetso bendrosios ligoninės mokslininkų, vieną dieną galėtų padėti pacientams greičiau gauti veiksmingiausią gydymą, o tai galėtų sumažinti plataus spektro antibakterinių vaistų poreikį.
Metodas, vadinamas genotipiniu ir fenotipiniu antibiotikų jautrumo tyrimu, naudojant RNR aptikimą, arba GoPhAST-R, analizuoja bakterijų augimą ir genetinį aktyvumą, kad būtų galima greitai nustatyti patogeno jautrumą įvairiems vaistams. Dabar mokslininkai įrodė šio požiūrio potencialą bandomajame tyrime, kuriame tiriamos pacientų, gydomų stacionariai dėl infekcijų, kraujo kultūrų.
Straipsnis publikuojamas išankstinio spausdinimo serveryje medRxiv. Išvados bus rodomos Klinikinės mikrobiologijos žurnalas.
„Šiuo tyrimu žengėme dar vieną žingsnį link platesnio tikslo, ty padėti žmonėms greičiau nustatyti diagnozes, kad pacientai greičiau pasveiktų“, – sakė vyresnysis tyrimo autorius Roby Bhattacharyya, Plataus MIT instituto asocijuotas narys. Harvardas, Harvardo medicinos mokyklos docentas ir Masačusetso bendrosios ligoninės (MGH) medicinos departamento Infekcinių ligų skyriaus gydantis gydytojas.
GoPhAST-R bandomasis važiavimas
Taikant GoPhAST-R metodą, mokslininkai bakterijų mėginius veikia įvairiais antibiotikais ir tada naudoja RNR aptikimo platformą, kad ieškotų skirtingų pasiuntinio RNR ekspresijos pokyčių modelių, atspindinčių bakterijų genų aktyvumo skirtumus.
Šie mRNR pokyčiai atsiranda praėjus vos kelioms minutėms po antibiotikų poveikio vaistams jautriose bakterijose, bet nepasireiškia vaistams atspariose. Be to, šis metodas tiria genus, kurie, kaip žinoma, yra atsparumo antibiotikams pagrindas, o tai gali suteikti užuominų apie pagrindinius bakterijų mechanizmus ir nurodyti galimas gydymo galimybes.
Ankstesniame darbe su nedideliu pacientų mėginių skaičiumi iš MGH klinikinės mikrobiologijos laboratorijos tyrimo grupė parodė, kad GoPhAST-R gali nustatyti jautrumą antibiotikams praėjus mažiau nei keturioms valandoms po bakterijų aptikimo kraujo pasėlyje, palyginti su 28–40 valandų naudojant standartinę klinikinę klinikinę. laboratoriniai metodai.
Naujajame tyrime jie išplėtė klinikinį bandomąjį laikotarpį, įtraukdami kraujo mėginius iš 42 pacientų, hospitalizuotų dėl Escherichia coli arba Klebsiella pneumoniae infekcijų, dviejų dažniausiai pasitaikančių patogenų, pastebėtų kraujo infekcijų metu.
Tyrėjai paveikė kraujo kultūras devynis skirtingus vaistus iš trijų skirtingų antibiotikų klasių ir vėliau atliko transkripcijos profiliavimą NanoString platformoje. Jie ištyrė mRNR pokyčius 10 kiekvienos antibiotikų klasės genų, taip pat keletą genų, kurie suteikia atsparumą beta laktaminiams vaistams.
Jų rezultatai 95% sutapo su rezultatais, gautais iš aukso standarto augimo pagrįstų jautrumo antibiotikams tyrimų. „Šiame bandomajame etape parodėme, kad GoPhAST-R yra metodas, kuris gali gerai veikti klinikoje”, – sakė Bhattacharyya.
„Kitas žingsnis bus parodyti GoPhAST-R naudą priimant sprendimus dėl pacientų priežiūros realiuoju laiku. Norėtume, kad vieną dieną tai būtų tyrimas, kurį būtų galima naudoti ligoninėse visur, siekiant padėti pacientams gauti veiksmingesnį gydymą be gydymo. skatinti atsparumą vaistams“, – pridūrė jis.
Bhattacharyya pripažino MGH klinikinės mikrobiologijos laboratorijos dalyvavimą, kad tyrimas būtų įmanomas, taip pat ligoninės pacientų indėlis. „Mes visiškai negalėtume padaryti šių atradimų be jų.”