Nauja platforma supaprastina epitopų palyginimą antikūnų tyrimuose

Nauja platforma supaprastina epitopų palyginimą antikūnų tyrimuose

Gyvensena mityba, dietos, judėjimas

Monokloniniai antikūnai yra labai svarbūs terapiniai vaistai dėl savo didelio specifiškumo ir surišimo afiniteto epitopams (tikslioms vietoms, kur antikūnas prisitvirtina prie antigeno, sukeldamas imuninį atsaką). Kadangi antikūnų terapinis veiksmingumas yra glaudžiai susijęs su jų tiksliniais epitopais, epitopų apibūdinimas yra būtinas norint suprasti antikūnų funkcionalumą.

Tačiau tradiciniai epitopų tyrimo metodai yra lėti ir daug darbo reikalaujantys. Todėl skubiai reikia veiksmingesnių metodų, kurie padėtų tiksliai ir greitai nustatyti epitopus ir galiausiai paspartintų naujos kartos gydymo metodų kūrimą.

Norėdami užpildyti šią spragą, Tokijo technologijos instituto mokslininkai pradėjo novatoriškus tyrimus, kurių rezultatas buvo naujos platformos, pavadintos Epitope Binning-seq, kūrimas. Jų išvados buvo paskelbtos 2024 m. gegužės 28 d Ryšių biologija. Epitope Binning-seq, įvertina epitopų panašumą naudojant genetiškai koduotus užklausos antikūnus (qAb) antigeną ekspresuojančiose ląstelėse ir naujos kartos seką (NGS), leidžiančią vienu metu įvertinti kelis qAb be atskiro gryninimo.

Šiame tyrime buvo naudojami užklausos antikūnai (qAb), rodomi HER2 ekspresuojančių ląstelių paviršiuje. Įvesdami fluorescenciniu būdu pažymėtus etaloninius antikūnus (rAb) ir naudodami srauto citometrijos analizę, mokslininkai galėjo atskirti ląsteles, kuriose qAb užmaskavo epitopus, ir ląsteles, kuriose jie to nepadarė.

Kai kurie qAb veiksmingai blokavo rAb prisijungimą prie antigeno, todėl atsirado ląstelių populiacija, kuri neprisijungia rAb, vadinama rAb neigiama populiacija. Ir atvirkščiai, kiti qAb leido rAb prisijungti prie antigeno, sukurdami ląstelių populiaciją su rAb prisijungimu, žinomą kaip rAb teigiama populiacija.

Atitinkamas tyrimo autorius, docentas Tetsuya Kadonosono, pateikdamas daugiau įžvalgų apie savo tyrimą, sako: „Diferencinis surišimo elgesys buvo pagrindas vertinant epitopų panašumą tarp skirtingų antikūnų. Atlikome NGS analizę surūšiuotoms rAb neigiamoms populiacijoms. identifikuoti ir sugrupuoti panašius qAb į epitopų dėžutes.

Rezultatai buvo gana daug žadantys. Epitope Binning-seq tiksliai suskirstė antikūnus į skirtingus epitopų dėžes, suteikdama vertingų įžvalgų apie jų surišimo būdus. Eksperimentuose, kuriuose naudojami modelio antikūnai pertuzumabas ir trastuzumabas, metodas tiksliai nustatė ir praturtino specifinius qAb, netgi aptikdamas klonus esant labai mažam pradiniam gausumui.

Platforma labai tiksliai suskirstė 14 qAb į tinkamas epitopų dėžes. Šios išvados parodo Epitope Binning-seq potencialą supaprastinti ankstyvą antikūnų vaistų kūrimą, vienu metu įvertinant milijonus qAb, pagreitinant perspektyvių terapinių kandidatų identifikavimą.

Šios platformos privalumai yra reikšmingi. Epitope Binning-seq supaprastina epitopų palyginimą, leidžiant greitai identifikuoti antikūnus su panašiais jungimosi būdais, o tai gali patobulinti tikslinę ir veiksmingą antikūnais pagrįstą terapiją. Metodo didelio masto įvertinimas gali pakeisti antikūnų apibūdinimą, todėl vienu metu galima įvertinti milijonus qAb.

„Epitope Binning-seq kūrimas yra didelė pažanga antikūnų vaistų atradimo srityje. Suteikdama greitą, išsamų ir ekonomišką metodą antikūnų epitopų panašumui įvertinti, ši nauja platforma įveikia tradicinių epitopų analizės metodų apribojimus”, – teigia Kadonosono. .

Daug žadantys šio tyrimo rezultatai išryškina šio metodo potencialą pakeisti ankstyvą antikūnų vaistų vystymąsi ir antikūnų afiniteto brendimą, atveriant kelią veiksmingesnėms terapinėms strategijoms ateityje.