Filadelfijos vaikų ligoninės (CHOP) ir Pensilvanijos universiteto Perelmano medicinos mokyklos tyrėjai sukūrė naują atrankos technologiją, Aptamer pagrindu pagrįstą T limfocitų aktyvumo atranką ir sekos nustatymą (ATLAS-seq), kad geriau identifikuotų su antigenu reaguojančias T ląsteles. kurie labiau linkę pasiūlyti didesnį imuninį atsaką prieš vėžines ląsteles. Išvados buvo paskelbtos šią savaitę Gamtos komunikacijos.
Mokslininkai nuolat kuria imunoterapinius gydymo būdus, kurie padeda imuninei sistemai atpažinti ir atakuoti specifinius vėžio ląstelių baltymų taikinius, taip pat žinomus kaip naviko antigenai, taip treniruodami organizmą veiksmingiau ir tiksliau kovoti su vėžiu. Siekiant šio tikslios medicinos metodo, būtina atrasti į antigenus reaguojančius T ląstelių receptorius (TCR).
TCR yra baltymų kompleksai, esantys T ląstelių paviršiuje, kurie atpažįsta ir jungiasi su antigeno peptidais, kuriuos pateikia pagrindinės histokompatibilumo komplekso (MHC) molekulės, sukeldami ląstelių atsakų kaskadą, dėl kurio suaktyvėja T ląstelės. Tačiau standartiniais antigenu reaguojančių TCR išskyrimo metodais dažnai nepavyksta nustatyti TCR, kurie veiksmingai aktyvuoja T ląsteles.
„ATLAS-seq nustatyti TCR paprastai yra veiksmingesni žudant tikslines ląsteles, nei tie, kurie identifikuoti taikant įprastines technologijas“, – sakė vyresnysis tyrimo autorius ir Vaikų ligoninės patologijos ir laboratorinės medicinos docentas Lan Linas, Ph.D. Philadelphia ir Penn Medicine. „Apskritai, ATLAS-seq pagerina TCR atranką, kad būtų galima efektyviau nustatyti antigenams reaktyvius TCR, turinčius didelį funkcinį aktyvumą.”
ATLAS-seq technologija sujungia vienos ląstelės metodą su aptamero pagrindu veikiančiu fluorescenciniu molekuliniu jutikliu, kuris skleidžia fluorescencinį signalą, kai suaktyvinama T ląstelė. Tyrimo metu mokslininkai sukūrė mikrofluidinę sistemą, skirtą atskirti atskiras T ląsteles, kurios reaguoja į dominančio antigeno peptido stimuliaciją, ir nustatė jų unikalias TCR sekas, naudodami vienos ląstelės seką.
„Įsivaizduojame, kad ATLAS-seq gali atlikti pagrindinį vaidmenį identifikuojant TCR, nukreiptus į naviko antigenus, skatinant naujų T ląstelių imunoterapijos metodų kūrimą daugeliui sunkiai gydomų vėžio formų“, – sakė Linas, kuris taip pat yra vėžio tyrėjas. Raymond G. Perelman ląstelinės ir molekulinės terapijos centras ir CHOP Kompiuterinės ir genominės medicinos centras.