Pasinaudojusi AI galia, Glazgo virusų tyrimų centro MRC universiteto tyrimų komanda pradėjo „Viro3D“-išsamiausią žmonių ir gyvūnų viruso baltymų struktūros duomenų bazę pasaulyje.
Nemokama ir ieškoma AI varoma duomenų bazė siūlo visiškai naują, išsamią virusų perspektyvą, leidžiančią greitai sužinoti daugiau apie jų kilmę ir evoliuciją.
Nors viruso dalelės yra gausiausios biologinės būtybės mūsų planetoje, šios mažos struktūros išlieka viena iš mažiausiai gerai suprantamų. Įžvalgos apie pagrindines virusų baltymų struktūras iki šiol buvo pasiektos tik atliekant lėtą ir sunkų tyrimų darbą – tempą, kuris paveikė mūsų sugebėjimą kurti gydymą ir vakcinas greičiu.
Dabar, stengiantis pagreitinti mūsų supratimą, tyrėjų komanda, kuriai vadovauja daktaras Joe Grove'as, Glazgo virusų tyrimų centro MRC universitete, panaudojo AI galią sukurti naują tūkstančių žmonių ir gyvūnų viruso baltymų duomenų bazę.
„Viro3D“ yra aukštos kokybės struktūriniai modeliai, skirti 85 000 baltymų iš 4 400 žmonių ir gyvūnų virusų-didžiausia išsamių žmonių ir gyvūnų virusų struktūrinių modelių duomenų bazė, padidindama mūsų dabartines žinias šioje srityje 30 kartų.
„Viro3D“ kūrėjai tikisi, kad duomenų bazė pradės naują žmonių ir gyvūnų virusų tyrimų erą ir pagreitins antivirusinių vaistų ir vakcinų vystymąsi prieš esamus endeminius virusus, tokius kaip hepatitas, ŽIV, „Comid Cold“ ir „Covid-19“, taip pat naujoms ir kylančioms pandeminėms grėsmėms.
Duomenų bazė, kuri neseniai buvo išsamiai aprašyta žurnale Molekulinės sistemos biologijajau atskleidė anksčiau nežinomą informaciją apie SARS-COV-2 genetines protėvius-virusą, atsakingą už Covidid-19.
VIRO3D duomenys rodo, kad pagrindinis baltymas SARS-COV-2, vienas iš tų, kurie atsakingi už infekciją, iš pradžių galėjo kilti iš genetinių mainų su protėvių herpes virusu-virusų šeima, atsakinga už įvairias ligas, įskaitant peršalimo opos ir vėjaraupius.
Tyrimo komanda sako, kad „Viro3D“ gali sugeneruoti daug daugiau informacijos, tokios kaip šis – evoliucinė virusų istorija ir kilmė – tūkstančiams skirtingų baltymų, padedant sušvelninti mūsų supratimą apie žmogaus ir gyvūnų virusus ir savo ruožtu kovoti su jais tempu.
Dr Joe Grove, pagrindinis autorius iš Glazgo virusų tyrimų centro MRC universiteto, sakė: „Mes tik suprantame didžiulę genetinę įvairovę virusų bendruomenėje. Virusai yra tokie pat seni kaip ląstelių gyvenimas, buvę maždaug milijardus metų.
„„ Viro3D “pateikia visiškai naują virusų perspektyvą, leidžiančią mums sužinoti apie jų kilmę ir evoliuciją. Mes tikimės, kad„ Viro3D “ir dirbtinis intelektas paspartins antivirusinių vaistų ir vakcinų skaičiavimo projektą nuo esamų endeminių virusų. Mes galime sugrąžinti šiuos dizainus į laboratorijas, o po to – į realųjį pasaulį.”
Baltymai yra gyvenimo blokai, atliekantys didžiulį mūsų ląstelių funkcijų spektrą ir vaidindami kritinį vaidmenį tiek sveikatos ir ligos. Norėdami suprasti, kaip veikia baltymai, tyrėjai turi sugebėti ištirti jų trimatę struktūrą.
Nors dirbtinio intelekto pažanga lėmė, kad buvo sukurtos bendrosios baltymų struktūros duomenų bazių, tokių kaip „Alphafld“ duomenų bazė ir evoliucinės skalės modeliavimo metagenominis atlasas, viruso baltymai iki šiol nebuvo pašalinti iš numatymo pastangų arba buvo įtrauktos tik į nedaug.