Metabolomikos naudojimas pneumoniją sukeliantiems patogenams nustatyti

Metabolomikos naudojimas pneumoniją sukeliantiems patogenams nustatyti

Ligos, sindromai

Veiksmingai gydyti sunkų pneumonijos atvejį dažnai yra sudėtinga. Gali būti sunku nustatyti už jo esantį patogeną. Ph.D. kandidatė Ilona den Hartog išbandė kažką naujo: „Atsakymų ieškojome medžiagose, kurias gamina mūsų pačių kūnas“. Den Hartogo disertacijos gynimas buvo rugsėjo 17 d.

Kai žmogus patenka į ligoninę sergantis sunkia pneumonija, gydytojai nedelsdami paskiria antibiotikų, veiksmingų prieš įvairias bakterijas. Den Hartog sako: „Tačiau daugeliu atvejų priežastis yra virusas arba bakterija, kuri yra mažiau jautri arba visai nejautri pasirinktiems antibiotikams. Abiem atvejais antibiotikai neveikia gerai. Gaila. kad jie vis dar duoti“.

Gėda pacientui, nes antibiotikai yra neveiksmingi, ir visuomenės gėda, nes dėl jų bakterijos gali tapti atsparios šiems dažniausiai naudojamiems antibiotikams.

Kultūra dažnai nepateikia aiškaus atsakymo

Norėdami nustatyti patogeną, sukeliantį pneumoniją, gydytojai iš paciento išskiria šiek tiek plaučių gleivių. Rezultatai užtrunka maždaug dvi dienas ir dažnai nepateikia aiškaus atsakymo. „Daugiau nei puse atvejų patogenas niekada nerandamas, todėl neįmanoma pritaikyti gydymo pacientui”, – sako Den Hartog. – Norėjome užpildyti šią spragą.

Den Hartogo vadovas Coenas van Hasseltas gavo dotaciją iš ZonMw, kad galėtų tai ištirti naudojant palyginti naują metabolomikos sritį. Šis tyrimas buvo atliktas naudojant pneumonija sergančių pacientų kraujo mėginių rinkinį, kuris buvo prieinamas bendradarbiaujant su Nieuwegeino Šv. Antonijaus ligonine.

Van Hasseltas paaiškina, kad diagnostiniai tyrimai iki šiol buvo skirti bakterijų paieškai, siekiant nustatyti pneumonijos priežastį. „Norėjome nustatyti priežastį per medžiagas, kurias mūsų organizmas gamina reaguodamas į infekciją. Ar galėtume pasakyti, pavyzdžiui, ar tai virusas ar bakterija?”

Kuris organizmas yra patogenas?

Tyrėjai norėjo išsiaiškinti, kuris organizmas buvo patogenas, ir ieškojo užuominų apie medžiagas, kurias gamina mūsų organizmas. Tam reikėjo įvairių sričių žinių. Van Hasseltas komentuoja, kad jiems reikėjo žmogaus, kuris galėtų sujungti visas šias kompetencijos sritis. „Ilona studijavo biomedicinos inžineriją ir entuziastingai bei pragmatiškai sprendė klinikinę pneumonijos problemą ligoninėje.

Šis tinklas apėmė klinikos patirtį ir anksčiau buvo paimti kraujo mėginiai iš plaučių uždegimu sergančių pacientų. Den Hartog taip pat bendradarbiavo su Leideno metabolizmo ir analizės centru, kuriam vadovauja Analitinių biomokslų profesorius Thomas Hankemeier, turintis didelę metabolitų, ty organizmo gaminamų medžiagų, nustatymo patirtį.

Den Hartog sako: „Mes nustatėme 347 metabolitus kraujo mėginiuose iš trijų grupių iš kelių dešimčių pacientų. Tai buvo žmonės, sergantys pneumokokine infekcija, netipinės bakterijos infekcija ir virusine infekcija.”

Tikisi greito testo

Natūralu, kad Den Hartog labai tikėjosi sukurti paprastą testą, kuris leistų greitai ir pigiai aptikti vieną ar kelis metabolitus kraujyje ir nedelsiant nurodyti pneumonijos tipą. Tai leistų gydytojams nedelsiant pradėti tinkamą gydymą. „Nors mes radome tris metabolitus, kurie suteikia svarbios informacijos, testas, reikalingas jiems išmatuoti, nėra geresnis už šiuo metu ligoninėse naudojamą.

Tai nuvylė, bet, laimei, nusivylimas truko neilgai, sako Den Hartog. „Kolegos man padėjo tai įveikti. Kai jaučiausi nusiminęs, kalbėjimas apie tai ir minčių šturmas, kaip elgtis toliau, buvo tikrai naudinga. Aš vėl galėjau pamatyti tyrimo vertę.”

Ir tikrai yra vertės, pabrėžia Van Hasseltas. „Nors mūsų testas nėra geresnis už dabartinį, jų derinimas gali būti labai naudingas. Tai įdomus pagrindas tolesniems tyrimams. Be to, šis tyrimas daug išaiškino, kas biochemiškai vyksta mūsų organizme tokios infekcijos metu ir kodėl kai kurie pacientai tapti daug sergamesni už kitus“.