Kumamoto universiteto mokslininkai padarė reikšmingą proveržį kovoje su COVID-19 sukūrę „„Intelli-OVI“,” pažangiausias diagnostikos įrankis, galintis greitai nustatyti naujus SARS-CoV-2 viruso variantus.
Darbas publikuojamas žurnale Ryšių medicina.
Ši nauja sistema sujungia pažangią DNR aptikimo technologiją su skaičiavimo algoritmais, kad pasiūlytų greitesnį ir ekonomiškesnį virusų mutacijų stebėjimo metodą, kuris galėtų atlikti lemiamą vaidmenį valdant būsimas pandemijas.
Nauja virusų aptikimo era
COVID-19 pandemijai progresuojant, nepaisant didėjančio skiepijimo ir bandos imuniteto nuo ankstesnių infekcijų, dėl kurių sumažėjo sunkių atvejų, palyginti su ankstyvomis stadijomis, atsirado naujų SARS-CoV-2 viruso variantų, keliančių didelių iššūkių visuomenei. sveikatos stebėjimas ir atsakas.
Tradiciniai metodai, tokie kaip viso genomo sekos nustatymas (WGS), nors ir tikslūs, yra daug laiko ir brangūs. „Intelli-OVI“ siūlo greitesnę alternatyvą, jungiančią „IntelliPlex“ mikrodisko technologiją su naujovišku algoritmu „Objective Variant Identification“ (OVI), kad būtų galima labai tiksliai aptikti ir atskirti daugiau nei 20 SARS-CoV-2 variantų.
„Mūsų sistemą galima lengvai atnaujinti, kad būtų galima sekti naujas virusines mutacijas,” sakė Kumamoto universiteto Jungtinio žmogaus retrovirusinės infekcijos tyrimų centro (JRCHRI) vadovaujantis mokslininkas profesorius Yorifumi Satou. „Šis prisitaikymas yra labai svarbus norint anksti aptikti atsirandančius variantus, leidžiančius greitai imtis veiksmų, kad būtų išvengta tolesnio plitimo.”
Kaip veikia Intelli-OVI
„IntelliPlex“ technologija naudoja mikro diskus, atspausdintus su unikaliu vaizdiniu raštu (πCode), kad užfiksuotų ir analizuotų specifines viruso genetines mutacijas. Tai leidžia sistemai vienu metu apdoroti kelias virusines mutacijas, o tai žymiai pagreitina aptikimo procesą. Tada OVI algoritmas interpretuoja duomenis, identifikuodamas žinomus ir naujus variantus, analizuodamas unikalius mutacijų modelius.
Laboratorinių tyrimų metu Intelli-OVI sėkmingai nustatė daugiau nei 20 variantų, įskaitant kelis omikroninio varianto potipius, naudodama 35 skirtingus DNR zondus. Skirtingai nuo tradicinių PGR metodų, kurie apsiriboja nedideliu mutacijų skaičiumi, Intelli-OVI teoriškai gali išanalizuoti iki 100 virusų mutacijų vietų vienu metu, todėl tai yra viena iš išsamiausių diagnostikos priemonių.
Žvelgiant į priekį
Sėkmingai plėtojant Intelli-OVI, Kumamoto universitetas yra pasirengęs reikšmingai prisidėti prie pasirengimo pasaulinei pandemijai. Mokslininkų komanda tikisi, kad šią technologiją bus galima pritaikyti kitiems sparčiai besivystantiems virusams, nes tai yra gyvybiškai svarbi priemonė ankstyvam aptikimui ir ribojimo pastangoms.
„Šis naujas diagnostikos įrankis gali pakeisti virusų mutacijų stebėjimą ne tik dėl COVID-19, bet ir dėl būsimų pandemijų.” pridūrė profesorius Satou.