Klinikų gebėjimą diagnozuoti ir gydyti lėtines ligas riboja mokslinis netikrumas dėl veiksnių, sukeliančių ligos riziką. Tyrimas, paskelbtas rugsėjo 2 d. Žurnale PLOS biologija pateikė Drs. Emily Van Syoc, Emily Davenport ir Seth Bordenstein iš Pensilvanijos valstijos universiteto, JAV, atskleidė pirmųjų trišakių ryšių tarp žmogaus genetinių variacijų, žarnyno mikobiomo pokyčių ir lėtinės ligos rizikos įrodymus.
Kai kurie žarnyno grybai yra susiję su žarnyno ligomis. Tačiau žmonių sąveika yra blogai suprantama, o mokslininkai anksčiau manė, kad žarnyno grybai turi būti nustatyti iš dietos. Norėdami ištirti ryšį tarp žmogaus genetinių variacijų ir virškinimo trakto grybelinių bendruomenių variacijų, tyrėjai atliko viso genomo asociacijos tyrimą apie žmogaus genetinių lokusų skaičių ir tipus, darančius įtaką žarnyno grybų santykinei gausumui. Jie pasiekė suporuotus žarnyno mikobiomo ir žmogaus genomo duomenis iš 125 asmenų per žmogaus mikrobiomo projektą.
Nustatę ir apibūdinus grybelius susijusius genetinius variantus, kuriais žmogaus genomo variacija susieja grybelinių bendruomenių pokyčius, jie patikrino, ar ryšiai tarp genetinių lokusų ir žarnyno grybelių turi įtakos žmogaus ligos rizikai.
Tyrėjai nustatė 148 su grybais susijusius variantus (FAV) per 7 chromosomas, kurios statistiškai siejo su 9 grybeliniais taksonais, atskleidžiančiais keletą genetinių ryšių su žarnyno grybeliais ir ligos rizika. Tyrimą apribojo nedidelė kohorta, tačiau pagrindinis rezultatas buvo patvirtintas nepriklausomoje didesnėje grupėje; Būsimi tyrimai gali paaiškinti, kaip žarnyno grybai gali tarpininkauti lėtinėms ligos rizikai ir geriau suprasti mechanizmą, kuriuo yra sujungti genetiniai variacijos ir žarnyno grybeliai.
Anot autorių, „nustatant, ar žmogaus genetika tuo pačiu metu siejasi su diferencinio mikrobų gausa ir ligos rizika, yra pagrindinis iššūkis, norint išspręsti esminį individualizuotos diagnostikos ir (arba) bioterapijos potencialą.
„Rezultatai nustato anksčiau nepripažintus ryšius tarp žmogaus genetikos, žarnyno grybelių ir lėtinės ligos, išplėsdamos žmogaus ir mikrobų sąveikos paradigmą žarnyne iki mikobiomo. Šis darbas pažvelgia į kanoninį, dviejų matmenų dėmesį į žmogaus genetiką ir žarnyno bakterijas į žarnyno grybinę biosferą.”
Bendras koreguojantis autorius Sethas Bordensteinas priduria: „Šis tyrimas yra pirmasis mūsų pagrindinis žingsnis siekiant suprasti žmogaus genetinių variacijų poveikį labai ištirta žarnyno mikroorganizmų grupei-mikobiomui-arba grybelinių rūšių bendruomenei, kuri atsiranda mūsų žarnyne.“
Bordensteinas sako: „Mes atskleidėme stebėtiną skaičių genetinių ryšių su specifiniais žarnyno grybeliais ir atradome ryšį tarp tam tikrų mielių, Kazachstanijos ir širdies ir kraujagyslių ligų rizikos, ypač įdomu būsimiems tyrimams ir patvirtinimui“.
Bendraautorė Emily Davenport pažymi, kad „žarnyno grybai yra labai nepakankamai ištirti, palyginti su kitais žarnyno mikrobais, tokiais kaip bakterijos ir Archaea. Mes daug mažiau žinome apie tai, kas lemia grybelius, kurie gyvena žarnyne, ir ar jie yra svarbūs žmonių sveikatai. Šie rezultatai pirmą kartą rodo, kad šeimininko genetika gali paveikti grybelius, kurie gyvena žarnyne, ir pateikia įkalčių, o fiziologiniai mechanizmai lemia jų didelę įtaką.
Davenportas priduria: „Šie rezultatai siūlo įdomų pirmąjį žvilgsnį į pagrindinį genetinį mikobiomo reguliavimą. Dar įdomesnis jie atveria dar daug klausimų apie tai, kaip tai įvyksta. Ar mes matysime skirtingas asociacijas skirtingose populiacijose? Ar yra sąveikos tarp žarnyno grybų ir žarnų bakterijų, kurias moduliuoja genetika? Mes džiaugiamės matydami naujus bandymus.
Pirmasis autorė Emily Van Syoc pažymi: „Šis tyrimas pradeda pirmąją kelionę, kad būtų galima atskleisti žmogaus žarnyno mikobiomo genetinius pagrindus. Mažoje atradimo GWAS kohortoje mes pastebime, kad žarnyno grybai, ypač į kommensalinę kazachstaniją, yra susiję su žmogaus genetiniais variantais, o požymiai-ligos būsenos. Mes džiaugiamės, kad tebevykstame, kad ši sritis yra susijusi su žmogaus genetiniais variantais, o požymiai ir ligos. prisidėti prie sveikatos ir ligų “.