Neseniai atliktas didelis kohortinis tyrimas, kurį kartu atliko mokslininkai iš BGI Genomics ir Nanjing Women and Children's Healthcare Hospital, įgyvendino pačių sukurtą prenatalinės patikros strategiją, kad būtų galima veiksmingai nustatyti ir klasifikuoti 128 tikrai teigiamus egzoninių kopijų skaičiaus variantus (CNV) sergant Diušeno raumenų distrofija. (DMD) geną naudojant neinvazinio prenatalinio tyrimo (NIPT) duomenis.
Pranešdamas apie 33 skirtingus patogeninius ar tikėtinus patogeninius motinos CNV DMD gene, šis tyrimas užpildo didelę informacijos spragą apie motinos CNV nešiotojų dažnį ir spektrą Kinijos populiacijoje.
Tyrimas publikuojamas žurnale Klinikinė ir transliacinė medicina.
Tyrėjai pakartotinai išanalizavo 135 047 NIPT mėginius, paimtus iš Nankino moterų ir vaikų sveikatos priežiūros ligoninės ir Sudžou savivaldybės ligoninės nuo 2017 m. sausio mėn. iki 2021 m. gruodžio mėn. Jie nustatė iš viso 224 motinos CNV DMD gene, iš kurių 128 buvo patvirtinti kaip tikrai teigiami egzoniniai. CNV.
Iš jų 48 buvo patobulinti specifiniai egzonai, o penki dideli patogeniški arba tikėtini patogeniniai CNV buvo patvirtinti naudojant chromosomų mikrogardelių analizę (CMA).
Patogeniniai ir pasikartojantys CNV
Iš 128 tikrai teigiamų CNV 64 buvo klasifikuojami kaip patogeniški arba tikėtinai patogeniški, 40 kaip neapibrėžtos reikšmės (VUS) variantai ir 24 kaip tikėtinai gerybiniai. Pažymėtina, kad 33 patogeniniai arba tikėtini patogeniniai CNV buvo rasti DMD gene, o kai kurie pakartotinai pasirodė specifiniuose egzonuose.
Be to, 12 iš 33 unikalių patogeninių CNV buvo pasikartojantys, dažniausiai randami 48–51 egzonuose, po to 51–52 egzonuose, 45–55 egzonuose ir 49–51 egzonuose. Naudodami duomenis iš Leideno atvirų variacijų duomenų bazės, mokslininkai sugebėjo numatyti galimus šių CNV fenotipus.
Genų ištrynimas trukdo vystytis
Tyrime taip pat buvo stebimi 7 iš 11 vyriškos lyties palikuonių, kurių amžius nuo 8 mėnesių iki 5 metų, siekiant ištirti kreatinkinazės (CK) koncentraciją serume ir galimas genetines sąlygas. Padidėjęs CK lygis buvo nustatytas 71,43% šių berniukų, o tai rodo galimas raumenų problemas.
Vienu atveju buvo aptikta tipiška DMD geno 48–50 egzonų delecija už kadro ribų. Nepaisant to, kad sulaukęs vienerių metų sūnus atrodė sveikas, jo CK lygis buvo labai aukštas (12 416,8 U/L), o tai rodo galimą Diušeno raumenų distrofijos (DMD) diagnozę.
Kitas atvejis buvo susijęs su reta kadro ištrynimu 2–9 egzonuose. Būdamas dvejų su puse metų berniukas parodė normalius motorinius įgūdžius ir CK lygį (125,4 U/L), tačiau uždelstas kalbos vystymasis ir nedideli elgesio sutrikimai. Šis ištrynimas yra susijęs su neurologinio vystymosi sutrikimais, o ne su DMD, kaip anksčiau buvo pastebėta monozigotiniams dvyniams, turintiems panašų genetinį profilį.
Pasaulinė svarba, kuri vadovauja būsimiems tyrimams
Tyrėjai atkreipė dėmesį į DMD geno variantų nešiklių dažnius įvairiose populiacijose, įskaitant Belgiją (1/2612), JAV (1/717) ir Izraelį (1/1046), pabrėždami šio genetinio tyrimo svarbą pasauliniu mastu. Šis tyrimas pabrėžia, kad reikia atlikti daugiau tyrimų ir ilgalaikės stebėsenos, kad būtų galima suprasti visą šių genetinių ištrynimų poveikį.
Naudojant esamus NIPT duomenis, tyrimas pristato ekonomišką metodą prenataliniam DMD geno CNV atrankai, praplečiant praktinį NIPT taikymą nereikalaujant papildomų investicijų.
Teikia BGI Genomics