Tarptautinė komanda, vadovaujama Weill Cornell medicinos tyrėjų, sukūrė testą, kuris padės išmatuoti ŽIV išlikimą žmonėms, paveiktiems virusų padermių, dažniausiai aptinkamų Afrikoje. Tai yra gyvybiškai svarbi priemonė ieškant gydymo nuo ŽIV, kuris būtų naudingas pacientams visame pasaulyje.
Tyrimas, paskelbtas m Gamtos komunikacijos liepos 2 d., padeda užpildyti didelę žmogaus imunodeficito viruso (ŽIV) tyrimų spragą. Dauguma ŽIV tyrimų buvo skirti Vakarų šalyse cirkuliuojančioms padermėms, daugiausia vyrams, turintiems lytinių santykių su B potipio paveiktais vyrais. Keletas tyrimų išnagrinėjo padermes, cirkuliuojančias Afrikoje, kur moterys yra neproporcingai paveiktos.
„Atliekant ŽIV gydymo tyrimus daugiausia dėmesio skiriama išsivysčiusiose šalyse cirkuliuojančioms virusų padermėms, tačiau norėdami pasiekti visame pasaulyje taikomą gydymą, turime ištirti virusų padermes, kurios veikia kitus pasaulio regionus“, – sakė pagrindinė autorė dr. Guinevere Lee, docentė. medicinos virusologijos Infekcinių ligų skyriuje ir mikrobiologijos bei imunologijos docentas Weill Cornell Medicine.
Išvados rodo, kaip ir kiti tyrimai išsivysčiusiose šalyse, kad Afrikoje cirkuliuojančios ŽIV padermės sukuria virusų rezervuarus žmogaus organizme. Nors antiretrovirusinis gydymas gali sumažinti ŽIV kiekį kraujyje iki neaptinkamo lygio, šie neveikiantys rezervuarai ir toliau išlieka.
Juose yra daug defektuotų provirusinių DNR genomų, kurie negali gaminti naujų infekcinių virusų, tačiau kai kurie genomai išlieka genetiškai nepažeisti ir yra pasirengę gaminti aktyvius virusus, jei antiretrovirusinis gydymas nutraukiamas.
Didelė dalis sugedusių virusų genomų užgožia tyrėjų bandymus tiksliai kiekybiškai įvertinti nepažeistų provirusų kopijas.
„Mes ieškome adatos šieno kupetoje: norėdami išgydyti ŽIV, pirmiausia turime išsiaiškinti, ar antiretrovirusinio gydymo metu organizme lieka nepažeistų genomo provirusų. Mūsų naujas tyrimas leidžia tai padaryti. Tada turime nukreipti ir pašalinti nepažeistą provirusinę DNR, galinčią gaminti naujus virusus“, – paaiškino dr. Lee.
ŽIV tyrimų objektyvo išplėtimas naudojant naują tyrimą
Dr. Lee ir jos kolegos išanalizavo DNR iš imuninių ląstelių, vadinamų CD4+ T ląstelės, kuriose slepiasi virusinė DNR, 16 moterų ir septynių vyrų, gydomų antiretrovirusiniu ŽIV Ugandoje. Genetinė viruso seka atskleidė du vyraujančius ŽIV-1 potipius: A1 ir D (pažymėtinai agresyvi padermė). Tyrimas taip pat nustatė virusinius A1 ir D hibridus.
Tada komanda modifikavo esamus laboratorinius tyrimus, kuriais nustatomi B potipio ŽIV provirusai, kad aptiktų provirusus, kurie yra A1 ir D potipiai. „Naujas mūsų sukurtas tyrimas padės tyrėjams sužinoti apie nepažeistus provirusinius genomus, susijusius su ŽIV gydymo tyrimais pacientams, sergantiems tai tirtos padermės“, – sakė daktaras Lee.
Dr. Lee ir jos daugianacionaliniai, kelių institucijų bendradarbiai jau naudoja naująjį tyrimą ilgalaikiam virusų išlikimui Ugandoje tirti. Jų išvados rodo, kad ŽIV provirusinio genomo kraštovaizdžio sudėtis iš esmės yra palyginama tarp A1, D ir B potipių, o tai rodo, kad metodai, skirti nukreipti į nepažeistus ŽIV rezervuarus Afrikoje, susidurs su panašiais „adata šieno kupetoje” iššūkiais kaip Šiaurės Amerikoje ir Europa.
Būsimuose tyrimuose taip pat reikės įvertinti ne B potipių skirtumus, kad būtų galima suprasti, ar specifiniai potipių veiksniai daro įtaką viruso rezervuarų išlikimui, reaktyvacijai ar klirensui.
Mokslininkai iš Simon Fraser universiteto, Kanados; Britų Kolumbijos ŽIV/AIDS kompetencijos centras, Kanada; Rakų sveikatos mokslų programa, Uganda; Keiptauno universitetas, Pietų Afrika; ir Johnso Hopkinso universiteto medicinos mokykla taip pat prisidėjo prie šio tyrimo.