Sinajaus kalno ICAHN medicinos mokyklos mokslininkai sukūrė galingą naują skaičiavimo įrankį, kuris galėtų pakeisti, kaip analizuojami vėžio audiniai, ir padėti paruošti kelią labiau suasmenintiems gydymui. Tyrimas, paskelbtas Gamtos biomedicinos inžinerijapristato „Marqo“-naujos kartos vaizdo analizės procesą, kuris išskiria išsamią ląstelių ir erdvinę informaciją iš naviko audinio skaidrių, su precedento neturinčiu tikslumu ir masteliu.
ICAHN medicinos mokyklos ICAHN medicinos mokyklos imunologijos ir imunoterapijos profesoriaus Sacha Gnjatic vadovaujama komanda, Marqo supaprastina sudėtingą užduotį analizuoti imunohistochemiją (IHC) ir imunofluorescencijos (IF) vaizdus, kurie susidaro dažymo metodais, kurie dažniausiai naudojami imuninėse ląstelėms nutraukti ląstelėms ir kitiems biomams.
Kai kas nors serga vėžiu, patologai apžiūri dažytų audinių pjūvius po mikroskopu, kad pamatytų, kurios ląstelės yra ir kaip jos išdėstomos. Tai daryti rankomis reikalaujama daug darbo ir paprastai apsiriboja mažomis imties plotais.
„Marqo“ sprendžia šį iššūkį trimis pagrindiniais būdais: pirma, nors kiti įrankiai gali apdoroti visus vaizdus, jie dažnai reikalauja, kad vartotojai pjaustytų skaidres į pataisas arba pasikliautų brangiomis skaičiavimo klasteriais. „Marqo“ neleidžia skaidrių nepažeisti ir baigia darbą per kelias minutes, o ne valandas, net ir standartiniuose grafikos apdorojimo įrenginiuose.
Antra, „Marqo“ dirba su daugybe įprastų IHC ir IF, jei dažymo technologijos, palengvina studijų ir studijų palyginimus ir padidina atkuriamumą. Trečia, „Marqo“ automatiškai pažymi tikėtinus teigiamas ląsteles ir priskiria koordinates ir žymeklių intensyvumą, tada pateikia galutinį patologą patologui, išlaikant žmonių patirtį darbo eigos centre.
„Mes sukūrėme„ Marqo “, kad užpildytume didelę spragą lauke: sudėtingus viso slidumo vaizdus paversti naudojamais, struktūrizuotais duomenimis greitai ir nuosekliai“,-sakė dr. Gnjatic. „Automatizuodami sunkų kėlimą, mes leidome ekspertams sutelkti dėmesį į aiškinimą ir atradimą.”
Nors „Marqo“ šiuo metu yra skirtas naudoti tyrimams ir nebuvo patvirtintas klinikinei diagnostikai, jo suderinamumas su standartiniais klinikinio dažymo metodais galėtų sudaryti sąlygas ateityje patologijos laboratorijose.
Tyrimo komanda planuoja toliau plėtoti „Marqo“, tobulindama savo vartotojo sąsają, pridedant pažangias erdvinės ir kaimynystės analizės įrankius ir išplėsdama jo naudojimą aukštos kokybės skaičiavimo aplinkoje, kad palaikytų didelio masto projektus, kuriuose dalyvauja milijonai skaitmeninių audinių skaidrių.
„Ši platforma galėtų pagreitinti biomarkerių atradimą, pagerinti tai, kaip mes prognozuojame, kurie pacientams bus naudingi konkretūs gydymo būdai, ir galiausiai palaikys tiksliesnės vėžio diagnostikos vystymąsi“, – sakė dr. Gnjatic.