COVID-19 pandemijos metais ne kartą buvo abejojama vyriausybės užsakytų pandemijos suvaldymo priemonių, tokių kaip reguliarūs tyrimai ir medicininių kaukių dėvėjimas, veiksmingumu.
Atlikdama plataus masto viruso genomo duomenų analizę, darbo grupė, vadovaujama DZIF tyrėjos prof. Alice McHardy iš Helmholtzo infekcijų tyrimų centro (HZI), dabar išsiaiškino, kad į Vokietiją pateko žymiai mažiau naujų SARS-CoV-2 koronaviruso variantų. dėl tam tikrų priemonių, pvz., medicininių kaukių dėvėjimo ir nemokamos prieigos prie greitų antigenų tyrimų, įvedimo.
Naujasis koronavirusas, žinomas kaip SARS-CoV-2, pirmą kartą pasirodė Kinijos Uhano mieste 2019 m. pabaigoje ir greitai išplito visame pasaulyje. Pirmasis atvejis Vokietijoje buvo patvirtintas 2020 m. sausį. 2020 m. pradžioje SARS-CoV-2 buvo nustatytas kaip infekcinės ligos COVID-19 priežastis, o Pasaulio sveikatos organizacija nuo 2020 m. pavasario ją priskyrė pandemijai.
Nefarmacinės intervencijos (NPI) buvo naudojamos siekiant sustabdyti SARS-CoV-2 plitimą ankstyvosiose pandemijos stadijose, kai nebuvo nei vakcinų, nei tikslinių vaistų infekcijai ir ligai gydyti. Šios NPI apėmė kontaktų su žmonėmis už namų ūkio ribų mažinimą, medicininių respiratorių nešiojimą ir, jei įmanoma, platų greitųjų antigenų tyrimų naudojimą. Pandemijai progresuojant kai kurių šių priemonių veiksmingumas buvo vis labiau abejotinas.
COVID-19 priemonių sėkmės Vokietijoje analizė
Mokslininkai Sama Goliaei ir Mohammad-Hadi Foroughmand-Araabi iš HZI prof. McHardy tyrimų grupės kartu su prof. Denise Kühnert grupe Roberto Kocho institute (RKI) ir Maxo Plancko geoantropologijos institute ištyrė intervencijų sėkmę. kurie buvo atlikti Vokietijoje.
Darbas publikuojamas žurnale Gamtos komunikacijos.
Šiuo tikslu mokslininkai išanalizavo beveik du milijonus SARS-CoV-2 genomų, kurie pandemijos metais atsirado Vokietijos populiacijoje ir buvo surinkti į duomenų bazę. Tada jie palygino naujų virusų variantų atsiradimą Vokietijoje pandemijos metu – kaip naujų variantų iš kitų pasaulio šalių įvedimo matą – su tam tikrų priemonių įvedimo laiku.
Rezultatai rodo, kad įsigaliojus tam tikroms priemonėms į Vokietiją pateko žymiai mažiau naujų viruso variantų. Tyrėjai užfiksavo didžiausią nuosmukį po nemokamų greitųjų antigenų tyrimų įvedimo, sugriežtinus medicininių kaukių dėvėjimo viešajame transporte ir mažmeninės prekybos vietose taisykles, taip pat apribojimų asmeniniam judėjimui ir susibūrimams.
Genomo sekų naudojimas SARS-CoV-2 variantams sekti
Koronaviruso pandemijos metu daugelis šalių stebėjo vyraujančių SARS-CoV-2 variantų genomų pokyčius, kad galėtų sekti plitimą ir naujų variantų atsiradimą. Pirmasis autorius Goliaei paaiškina: „Šis stebėjimas lėmė precedento neturintį genomo sekų kiekį, kurį buvo galima panaudoti viruso padermių erdviniam plitimui ir evoliucijai atkurti. Iš šio fondo panaudojome 1,8 mln. SARS-CoV-2 genomo duomenų, kurie buvo surinkti. nuo 2020 m. pabaigos iki 2021 m. pradžios, ty per trečiąją pandemijos bangą Vokietijoje.
Siekdami išsiaiškinti, kaip pandemijos suvaldymo priemonių įvedimas paveikė SARS-CoV-2 viruso variantų plitimą, mokslininkai taiko naują metodą, vadinamą „filogeografine Bajeso analize“.
Bajeso filogeografija yra evoliucinės biologijos ir biogeografijos tyrimų sritis, kurioje naudojami specializuoti statistiniai metodai, siekiant nustatyti erdvinius ir laiko modelius rūšių judėjime ir evoliucijoje. Taikant šį metodą, informacija iš genetinių duomenų, tokių kaip DNR sekos, yra derinama su geografiniais duomenimis, kad būtų galima atkurti populiacijų plitimą ir skirtumus.
Nemedikamentinių intervencijų (NPI) įtaka SARS-CoV-2 plitimui Vokietijoje
Naudodami tris mėginių ėmimo strategijas, tyrėjai iš aukščiau minėto duomenų rinkinio nustatė į Vokietiją įvežtas SARS-CoV-2 linijas ir atitinkamą įvežimo laiką. Siekdama nustatyti intervencijų įtaką šių linijų įvedimui ir plitimui, grupė surinko informaciją iš paskelbtų šaltinių apie daugiau nei 4000 intervencijų, įgyvendintų Vokietijoje, ir suskirstė jas į dvylika visa apimančių NPI.
Tada šių suskirstytų ir klasifikuotų NPI įvedimo ir taikymo laikotarpiai buvo koreliuojami su viruso linijų geografiniu ir laikinu pasireiškimu, siekiant nustatyti intervencijų įtaką viruso įvežimui ir jo paplitimui Vokietijoje.
„Ypač po nemokamų greitųjų antigenų tyrimų suteikimo ir sugriežtinus medicininių respiratorių naudojimo reglamentus, naujų SARS-CoV-2 variantų įvežimas į Vokietiją labai sumažėjo“, – sako Foroughmand-Araabi. Šios priemonės taip netrukdo kasdieniam gyvenimui, kaip, pavyzdžiui, įsakymai be kontakto, todėl jas būtų galima greitai ir visapusiškai panaudoti būsimų pandemijų metu siekiant užkirsti kelią viruso plitimui.
„Analizės rezultatai ne tik suteikė įžvalgų apie viruso elgesį pandemijos metu“, – reziumuoja grupės vadovas prof. McHardy.
„Svarbu, kad tyrime naudojama metodika gali padėti nustatyti sąsajas tarp aplinkos veiksnių ir patogeno plitimo ankstyvose galimų būsimų pandemijų stadijose. Tokiu būdu būtų galima greičiau gauti įrodymų apie tam tikrų NPI veiksmingumą. “
Teikia Vokietijos infekcijų tyrimų centro