Prahos Chemijos ir technologijos universiteto mokslininkai kartu su kolegomis iš Karinės sveikatos instituto ir Prahos vandens tiekimo ir kanalizacijos įmonės sėkmingai panaudojo nanoporomis pagrįstą seką, kad nustatytų SARS-CoV-2 variantų paplitimą nuotekose visoje Prahoje.
Tyrimas, paskelbtas m Chemosferarodo, kad nuotekų epidemiologija (WBE) gali būti išankstinio įspėjimo apie naujus COVID-19 variantus sistema, galinti suteikti svarbių duomenų prieš klinikinių mėginių rezultatus.
Tyrimas, atliktas nuo 2021 m. kovo iki 2022 m. vasario mėn., apėmė 300 nuotekų mėginių paėmimą iš įvairių Prahos subkanalizacijų, 80 iš jų buvo sekvenuoti. Šios teritorijos apėmė gyvenamuosius pastatus, ligonines, autobusų terminalą ir pagrindinę Prahos kanalizaciją, apimančią įvairaus gyventojų skaičiaus ir dinamikos rajonus.
Tyrimo metu daugiausia dėmesio buvo skiriama alfa (B.1.1.7), delta (B.1.617.2) ir omikrono (B.1.1.529) variantų bangoms stebėti.
„Mūsų išvados rodo, kad nustatytų SARS-CoV-2 RNR kopijų skaičius nuotekose padidėjo anksčiau nei klinikiniuose mėginiuose, o tai rodo, kad WBE gali būti ankstyvas būsimų infekcijos bangų rodiklis“, – sakė atitinkama tyrimo autorė Kamila Zdeňková. „Ši ankstyvo aptikimo galimybė yra gyvybiškai svarbi norint laiku įgyvendinti visuomenės sveikatos intervencijas.
Tyrimas atskleidė reikšmingus SARS-CoV-2 linijų progresavimo dinamikos skirtumus įvairiose tirtose vietovėse. Visų pirma, vietovėse, kuriose gyventojų tankis ir mobilumas didesnis, naujų variantų paplitimas buvo greitesnis. Šie smulkūs geografiniai duomenys pagerina galimybę prognozuoti ir efektyviau valdyti galimus protrūkius.
„Atskirų vietovių mieste stebėjimas suteikia vertingų įžvalgų, kurios ne visada akivaizdžios vien iš klinikinių duomenų“, – sakė pirmoji tyrimo autorė Alžběta Dostálková. „Šis metodas gali padėti tikslingai reaguoti į protrūkius, todėl visuomenės sveikatos strategijos tampa veiksmingesnės ir veiksmingesnės.”
Šiame tyrime pasirodė veiksminga nanoporų seka, pasirinkta dėl jos tinkamumo ir priimtinumo SARS-CoV-2 stebėjimui. Metodika leido tyrėjams identifikuoti ir kiekybiškai įvertinti SARS-CoV-2 RNR nuotekų mėginiuose, o tai suteikė išsamų viruso plitimo Prahoje vaizdą.
„Šis tyrimas pabrėžia, kaip svarbu išlaikyti tvirtas stebėjimo sistemas, net kai COVID-19 pandemija stabilizuojasi“, – pridūrė Zdeňková. „Nuotekų epidemiologija tebėra esminė priemonė stebint ir kontroliuojant ne tik SARS-CoV-2 ir jo variantų, bet ir kitų nuotekose išskiriamų ir aptinkamų virusų plitimą.
Mokslininkų grupės darbas yra reikšmingas indėlis į SARS-CoV-2 varianto pasiskirstymą nuotekose ne tik Prahoje, bet ir visame Europos regione. Pabrėždamas WBE veiksmingumą, šis tyrimas remia jos tolesnį naudojimą ir plėtrą kaip pagrindinę visuomenės sveikatos infrastruktūros dalį.