Tyrėjai iš Šiaurės Karolinos valstijos universiteto nustatė, kad kelios Gardnerella rūšys, bakterijos, kartais susijusios su bakterine vaginoze (BV) ir priešlaikiniu gimdymu, gali egzistuoti tame pačiame makšties mikrobiome. Išvados, paskelbtos m mSystemspapildo besiformuojančią Gardnerella poveikio žmonių sveikatai vaizdą.
Gardnerella yra anaerobinių bakterijų grupė, kuri dažniausiai randama makšties mikrobiome. Didesnis bakterijų kiekis yra BV požymis ir susijęs su didesne priešlaikinio gimdymo rizika, tačiau jis taip pat randamas moterims, kurios neturi ligos požymių.
„Mes bandėme suprasti Gardnerella įvairovę”, – sako Ben Callahan, NC valstijos gyventojų sveikatos ir patobiologijos docentas ir atitinkamas darbo autorius.
„Mokslininkai tik neseniai pradėjo nagrinėti atskiras Gardnerella rūšis, todėl dar nežinome, ar skirtingos rūšys gali turėti skirtingą poveikį sveikatai. Taigi mūsų pagrindinis tikslas buvo ištirti Gardnerella ekologiją.”
Unikalus iššūkis nustatant makšties mikrobiomo seką yra tas, kad bet kokius mėginius daugiausia sudarys šeimininko DNR, todėl mikrobų duomenų išgavimas yra brangesnis ir užima daug laiko. Pirmasis tyrimo grupės darbas buvo sukurti metodiką, leidžiančią iš mikrobiomų duomenų identifikuoti skirtingas Gardnerella rūšis.
„Turimais įrankiais makšties mikrobiomui tirti visos Gardnerella būtų laikomos tomis pačiomis rūšimis“, – sako Hanna Berman, NC valstijos doktorantė ir pagrindinė darbo autorė. „Kad net galėtume atlikti šį darbą, turėjome sukurti savo Gardnerella genomų duomenų bazę ir sukurti metodą, kaip identifikuoti skirtingas Gardnerella rūšis. Tikimės, kad tai taip pat leis daugiau tyrėjų ištirti Gardnerella įvairovę.”
Tyrimo grupė ištyrė trijų grupių duomenis: dvi atsitiktines nėščių moterų populiacijas ir vieną populiaciją, kuriai buvo priešlaikinis gimdymas. Jie išanalizavo Gardnerella metagenomines sekas iš mėginių, kad sužinotų, ar yra ryšys tarp tam tikros Gardnerella rūšies ir priešlaikinio gimdymo.
Nors jie nerado „rūkančio ginklo“, jie padarė du netikėtus atradimus.
Pirma, jie tarp mėginių nustatė galimą 14-ąją Gardnerella rūšį – iki šio darbo buvo nustatyta tik 13 rūšių.
Jie taip pat pastebėjo, kad daugumoje mėginių, kuriuose buvo Gardnerella, tame pačiame mikrobiome kartu egzistavo kelios Gardnerella rūšys: viename mėginyje buvo rasta nuo dviejų iki net 14 žinomų Gardnerella rūšių.
„Paprastai, jei bakterijų rūšis kolonizavo aplinką, mes tikimės, kad ji neįtrauks į artimus giminaičius, kurie užimtų tą pačią aplinkos nišą ir sunaudotų tuos pačius išteklius”, – sako Callahanas. „Dažnai sakau, kad su bakterijomis viskas įmanoma, bet tai vis tiek neįprasta. Taip pat matėme, kad kai bendras mikrobų kiekis didesnis, Gardnerella yra didesnė mikrobų kiekio dalis.
„Toliau kaupiasi įrodymai, kad Gardnerella siejasi su priešlaikiniu gimdymu, tačiau šio ryšio detalės yra sudėtingos. Šiame darbe mes neradome vienos blogos Gardnerella rūšies – jos visos gali būti blogos. Tai toli gražu nėra istorijos pabaiga“.
Tyrėjai tikisi toliau tirti rūšių sambūvio ir mikrobiomų sudėties klausimus būsimame darbe.
„Makšties mikrobiomas buvo nepakankamai ištirtas“, – sako Callahanas. „Pavyzdžiui, jame dažnai dominuoja viena Lactobacillus rūšis, kuri sukuria aplinką, kuri pašalina kitas bakterijas. Kai jos nėra, yra Gardnerella. Taigi, kaip bakterijos sąveikauja?
„Atsakymas į šiuos klausimus gali padėti veiksmingiau gydyti BV ir numatyti būdus, kaip numatyti ir išvengti priešlaikinio gimdymo. Šis darbas yra svarbus šio proceso žingsnis.”