Naujasis AI metodas galėtų pagerinti audinių, naviko analizę ir paankstinti ligos gydymą

Naujasis AI metodas galėtų pagerinti audinių, naviko analizę ir paankstinti ligos gydymą

Ligos, sindromai

Mičigano universiteto ir Browno universiteto mokslininkai sukūrė naują skaičiavimo metodą sudėtingiems audinių duomenims analizuoti, kurie galėtų pakeisti mūsų dabartinį supratimą apie ligas ir jų gydymo būdus.

Integruojantis ir referencinis audinių segmentavimas arba IRIS yra naujas mašininio mokymosi ir dirbtinio intelekto metodas, suteikiantis biomedicinos tyrėjams galimybę peržiūrėti tikslesnę informaciją apie audinių vystymąsi, ligos patologiją ir naviko organizavimą.

Išvados paskelbtos žurnale Gamtos metodai.

IRIS remiasi duomenimis, sugeneruotais naudojant erdvinę transkriptomiką, ir unikaliai naudoja vienos ląstelės RNR sekos nustatymo duomenis kaip nuorodą, kad vienu metu būtų galima ištirti kelis audinio sluoksnius ir išskirti įvairius regionus precedento neturinčiu tikslumu ir skaičiavimo greičiu.

Skirtingai nuo tradicinių metodų, kurie duoda vidutinius duomenis iš audinių mėginių, SRT suteikia daug smulkesnį vaizdą, tiksliai nustatydamas tūkstančius vietų vienoje audinio dalyje. Tačiau iššūkis visada buvo interpretuoti šį didžiulį ir išsamų duomenų rinkinį, sako Xiang Zhou, Mičigano universiteto Visuomenės sveikatos mokyklos biostatistikos profesorius ir vyresnysis tyrimo autorius.

Didelių ir sudėtingų duomenų rinkinių aiškinimas yra ta vieta, kur IRIS tampa naudinga priemone – jos algoritmai rūšiuoja duomenis, kad nustatytų ir segmentuotų įvairias funkcines sritis, pvz., naviko regionus, ir suteiktų įžvalgų apie ląstelių sąveiką ir ligos progresavimo mechanizmus.

„Skirtingai nuo esamų metodų, IRIS tiesiogiai apibūdina audinių ląstelių kraštovaizdį ir identifikuoja biologiškai interpretuojamas erdvines sritis, taip palengvindamas ląstelių mechanizmo, kuriuo grindžiama audinių funkcija, supratimą“, – sakė UM doktorantas Ying Ma, Browno universiteto biostatistikos docentas. kurie padėjo sukurti IRIS.

„Tikimės, kad IRIS bus galinga priemonė plataus masto erdvinės transkriptomikos duomenų analizei įvairiose įvairiose biologinėse sistemose.

Zhou ir Ma pritaikė IRIS šešiems SRT duomenų rinkiniams ir palygino jo veikimą su kitais dažniausiai naudojamais erdvinio domeno metodais. Galų gale, kadangi SRT technologija ir toliau populiarėja ir naudojama, mokslininkai tikisi, kad tokie metodai kaip IRIS padės potencialiai sukurti klinikinių intervencijų ar vaistų taikinius, pagerinti individualizuotus gydymo planus ir pacientų sveikatos rezultatus.

„IRIS skaičiavimo metodas yra naujas būdas biologams gilintis į sudėtingų audinių architektūrą, suteikiant neprilygstamas galimybes ištirti dinaminius procesus, formuojančius audinių struktūrą vystymosi ir ligos progresavimo metu“, – sakė Zhou.

„Apibūdindama rafinuotas audinių struktūras ir išaiškindama jų pokyčius ligos metu, IRIS turi potencialą atskleisti mechanines įžvalgas, būtinas norint suprasti ir kovoti su įvairiomis ligomis.”