Naujas metodas siūlo greitesnį ir tikslesnį patogeno identifikavimą net sudėtingose ​​DNR sekose

Naujas metodas siūlo greitesnį ir tikslesnį patogeno identifikavimą net sudėtingose ​​DNR sekose

Gyvensena mityba, dietos, judėjimas

Tyrėjų komanda iš Case Western Reserve universiteto medicinos mokyklos sukūrė naują tikslinės DNR sekos amplifikacijos, testavimo ir analizės metodą.

Ši nauja technika arba reakcija, žinoma kaip AMPLON (DNR amplifikavimas su daugiašakiu pradiniu ir nukleino rūgšties ciklo optimizavimu), siūlo alternatyvą anksčiau priimtam „auksinio standarto“ polimerazės grandininės reakcijos (PCR) metodui, atverdama galimybę naudoti daugiau programų. medicininėje diagnozėje.

Grupės išvados neseniai buvo paskelbtos žurnale Pažangios medžiagos.

„AMPLON gali teigiamai pakeisti molekulinės analizės ir klinikinės diagnostikos atlikimo būdą“, – sakė Mohamedas S. Drazas, Medicinos mokyklos docentas ir tyrimo pagrindinis tyrėjas, „nuo infekcinių ligų diagnostikos iki individualizuotos medicinos ir aplinkosaugos“. stebėjimas“.

Kaip tai veikia

Tyrėjai naudoja tokią technologiją, kad palygintų sergančių ląstelių DNR su sveikų ląstelių DNR, kad galėtų geriau suprasti ligai progresuojančius pokyčius ir kaip ją gydyti.

AMPLON suteikia kelis išplėtimus išilgai DNR grandinės, kad tuo pačiu metu padidėtų DNR sintezės greitis ir tikslumas pastovios temperatūros sąlygomis.

Naudojant šį naują supaprastintą procesą, nebereikia dirbti tarp aukštos ir žemos temperatūros kraštutinumų, kurie gali sukelti medžiagų apkrovą. Taip pat stiprinimo procesas tampa labiau struktūrizuotas ir prieinamas, ypač tais atvejais, kai tiksli temperatūros kontrolė yra sudėtinga.

Naudojant tradicinį PGR metodą, DNR mėginys kaitinamas, kad galėtų atskirti į dvi viengrandės DNR dalis. Tada fermentas sukuria dvi naujas DNR grandines, naudodamas pradines grandines kaip šablonus. Procesas yra varginantis, daug laiko reikalaujantis ir brangus.

„Mes sukūrėme naują DNR amplifikacijos metodą, kuriam nereikia didelės laboratorinės įrangos, tačiau jį galima atlikti vienu žingsniu ir įvairiomis sąlygomis“, – sakė Drazas. „Dar svarbiau, kad mūsų požiūris nesusilpnina fermentų, tokių kaip PGR metodas.”

AMPLON daugiafunkcinis DNR pradmenų dizainas gali paversti fermentų trūkumus stiprybėmis, siekiant pagerinti amplifikacijos efektyvumą ir gauti nuoseklius rezultatus.

„Mes sugebėjome sustiprinti stiprinimą ir sutrumpinti stiprinimo laiką 50 proc.“, – sakė Drazas. „Mūsų požiūris gali dramatiškai pakeisti nukleorūgščių amplifikacijos atlikimo būdą, vietoj to suteikdamas nešiojamą, patikimą ir ekonomišką sprendimą, skirtą programoms, pradedant diagnostikos tašku ir baigiant lauko tyrimais.