Naujas senėjimo atlasas suteikia mokslininkams išsamų vaizdą apie tai, kaip atskiros kirminų ląstelės ir audiniai sensta ir kaip skirtingos gyvenimo trukmės pratęsimo strategijos gali sustabdyti laikrodį. Darbas publikuojamas žurnale Gamtos senėjimas.
Senėjimas veikia visus mūsų kūno audinius – nuo raumenų iki odos. Išsiaiškinimas, kaip atskiri audiniai ir ląstelės sensta, galėtų padėti mokslininkams geriau suprasti senėjimo procesą ir padėti kurti senėjimą stabdančius gydymo būdus.
Dėl trumpos gyvenimo trukmės, paprastų kūno planų ir genetinio panašumo į žmones daugelis mokslininkų tiria apvaliųjų kirmėlių senėjimą. Siekdama pažvelgti į senėjimą audinių ir ląstelių lygmeniu, tyrėjų iš HHMI Janelia tyrimų miestelio, Baylor medicinos koledžo ir Kreitono universiteto medicinos mokyklos profiliavo genų ekspresiją kiekvienoje suaugusių apvaliųjų kirmėlių ląstelėje skirtingu senėjimo proceso metu. Jie taip pat profiliavo ilgaamžius kirminų padermes.
Mokslininkai surinko savo rezultatus į pilną transkriptinį apvaliųjų kirmėlių senėjimo ląstelių atlasą. Atviros prieigos atlasas leidžia mokslininkams pažvelgti į tai, kokie genai yra ekspresuojami visose kirminų ląstelėse tuo pačiu metu ir kaip laikui bėgant keičiasi genų ekspresija, tiek laukinių kirminų, tiek kirminų, kurių gyvenimo trukmė ilgesnė.
Naudodami atlasą tyrėjai sukūrė specifinius audinių „senėjimo laikrodžius“ – nuspėjamuosius modelius, kuriuos naudojo norėdami išsiaiškinti unikalias skirtingų audinių senėjimo ypatybes. Tyrėjai naudojo šiuos laikrodžius, kad geriau suprastų ilgaamžių kirminų padermių senėjimą stabdančius mechanizmus.
Tyrėjai taip pat sukūrė pirmąjį lytinių ląstelių likimo trajektorijos žemėlapį, kuriame sekama, kaip laikui bėgant vystosi reprodukcinės ląstelės, leidžianti komandai atrasti su amžiumi susijusius ląstelių sandaros ir genų ekspresijos pokyčius įvairiuose reprodukcinių ląstelių etapuose.
Atlasas taip pat leido komandai gauti vaizdą apie poliadenilinimą, pagrindinį genų reguliavimo ir baltymų įvairinimo mechanizmą, per visą kirminą senstant. Jie atrado daugybę su amžiumi susijusių pokyčių skirtinguose ląstelių tipuose, o tai rodo anksčiau nežinomą ryšį tarp šio mechanizmo ir senėjimo.
Naujos išvados ne tik suteikia tyrėjams įžvalgų apie senėjimą molekuliniu lygmeniu, bet ir naujasis atviros prieigos atlasas ir kartu esantis patogus duomenų portalas taip pat yra šaltinis kitiems tyrėjams.