Kaip žmogaus gauti RNR fragmentai padeda hepatito E virusui

Kaip žmogaus gauti RNR fragmentai padeda hepatito E virusui

Ligos, sindromai

Kodėl kai kuriems pacientams hepatitas E tampa lėtinis ir kodėl vaistai neveikia? Norėdami tai išsiaiškinti, tarptautinė tyrimų grupė, vadovaujama Bochumo mokslininkų, daugiau nei metus stebėjo pacientą, sergantį lėtine hepatito E infekcija.

Pakartotinis viruso RNR sekos nustatymas parodė, kad virusas į savo genomą įtraukė įvairias šeimininko pasiuntinio RNR dalis. Tai lėmė replikacijos pranašumą, dėl kurio infekcija galėjo tapti lėtinė.

„Vadinamasis šeimininko RNR įterpimas gali numatyti ūminės infekcijos perėjimą prie lėtinės būklės“, – sako Dr. Daniel Todt, Bochumo Rūro universiteto Medicinos ir molekulinės virusologijos katedros Kompiuterinės virusologijos tyrimų grupės vadovas. Vokietija.

Tyrėjai praneša žurnale Gamtos komunikacijos 2024 m. birželio 6 d.

Virusų populiacijos sekos nustatymas

Pasaulyje hepatitu E kasmet suserga apie 20 milijonų žmonių. Paprastai infekcija užgyja be pasekmių, tačiau ji gali būti pavojinga nėščių moterų ar žmonių, kurių imuninė sistema susilpnėjusi, gyvybei. Kai kuriais atvejais jis tampa lėtinis. Specifinių veiksmingų vaistų nėra. Plataus veikimo spektro antivirusinis vaistas Ribavirinas taip pat vartojamas nuo hepatito E, tačiau jis ne visada veikia.

Kaip virusas gali išvengti imuninės sistemos? Kodėl infekcija tampa lėtinė ir neužgyja? Tyrėjai norėjo išsiaiškinti ir pirmą kartą išanalizuoti visas chroniškai užsikrėtusio paciento virusų populiacijas per daugiau nei metus. Jie išsamiai ištyrė daugiau nei 180 atskirų sekų iš kraujo mėginių.

Kaip žmogaus gauti RNR fragmentai padeda hepatito E virusui

Replikacija ląstelių kultūroje yra naudinga šeimininko RNR

„Hepatito E virusas savo genetinėje informacijoje turi vadinamąjį hiperkintamąjį regioną, į kurį jis gali įtraukti įvairias RNR sekas iš šeimininkų ląstelių“, – sako Todtas.

Jo komanda sugebėjo parodyti, kad šio regiono sudėtis labai pasikeitė per stebėjimo laikotarpį. Be to, vienu metu atsirado daug skirtingų kompozicijų. Ląstelių kultūros eksperimentuose buvo įrodyta, kad šeimininko RNR įtraukimas suteikė replikacijos pranašumą: pakeisti virusai gali daugintis geriau nei kiti.

„Manome, kad tai iš dalies yra atsakinga už tai, kad infekcija tampa lėtinė ir gydymas nepavyko“, – sako Todtas.

Mokslininkai ištyrė į virusą įtrauktos šeimininko RNR sudėtį, kad nustatytų, ar yra kokių nors bendrų genų segmentams būdingų bruožų.

„Tačiau negalėjome aptikti jokių reikšmingų panašumų“, – sako Todtas. Įtrauktos genų sekos vyrauja tos, kurios yra labai dažnos ląstelės-šeimininkėse, o tai rodo atsitiktinę atranką.

„Galbūt, užsikrėtus hepatitu E, organizme vyksta lenktynės tarp viruso ir imuninės sistemos“, – spėja Todtas. Jei virusui pavyksta įtraukti šeimininko RNR, kol imuninė sistema sėkmingai kovoja su infekcija, tai gali sukelti lėtinę eigą.

„Viruso genome esanti šeimininko RNR bet kuriuo atveju gali būti biomarkeris ūminėje infekcijos fazėje, o tai anksti rodo, kad ji gali tapti lėtine.

Tyrėjai planuoja išplėsti savo tyrimus į didesnes pacientų grupes.