Omikos analizė – tai didelių duomenų rinkinių analizės procesas, siekiant išgauti prasmingą informaciją apie biologines molekules – genus, DNR, RNR, baltymus, metabolitus ar daugiau – siekiant apšviesti tipiškus molekulinius kelius ir iššifruoti, kur viskas susiklosto sergant ligomis.
Tyrime, kuriam vadovavo medicinos mokslų daktaras Bruno A. Benitezas, žmogaus genetikas ir Neurobiorepository direktorius Beth Israel Deaconess medicinos centre (BIDMC), tyrėjai naudojo mašininio mokymosi metodus, kad integruotų didelio našumo transkriptinį, proteominį, metabolominį. , ir lipidominius profilius, kad suteiktų naujų kritinių molekulinių įžvalgų apie Alzheimerio ligą (AD), kurių negali pasiūlyti vienkartinės analizės. Straipsnis publikuojamas žurnale PLOS biologija.
Kryžminis metodas nustatė keturis skirtingus AD molekulinius profilius, iš kurių vienas buvo susijęs su blogesnėmis kognityvinėmis funkcijomis ir neuropatologiniais požymiais, įskaitant žymiai didesnį klinikinį demencijos įvertinimą mirties atveju, trumpesnę gyvenimo trukmę po simptomų atsiradimo, sunkesnę neurodegeneraciją ir neurouždegimą bei sumažėjusį demencijos lygį. metabolominiai profiliai.
Šis molekulinis profilis buvo daugelyje paveiktų žievės regionų, susijusių su labiau pažengusia liga, ty tuose, kuriuose yra daugiau tau baltymų patologijos, pastebėtų sergant AD, taip pat reikšmingas su sinapsėmis susijusių genų ir signalizacijos takų reguliavimas, pakeistas ankstyvoje ir vėlyvoje AD stadijoje. .
Grupės rezultatai rodo, kad kryžminės omikos analizės gali užfiksuoti skirtumus ir nustatyti sudėtingų ir nevienalyčių ligų, tokių kaip Alzheimerio liga, molekulinius skirtumus, kurių kitu atveju trūksta taikant vieno modalumo omikos metodus. Taikydami šį metodą, mokslininkai gali geriau suprasti šią ligą ir kitas ligas bei paruošti kelią naujiems proveržiams ir galimiems gydymo metodams.
Kryžminiai metodai gali būti galinga priemonė tyrėjų pastangoms suprasti Alzheimerio ligą, sakė Benitezas. „Šie metodai yra ne tik pranašesni už vienkartines analizes, bet ir suteikia neįkainojamų molekulinių įžvalgų apie šios ligos patogenezę“, – pridūrė jis.
„Mes nustatėme ankstyvos ligos stadijos molekulinius žymenis, atspindinčius sinapsinę disfunkciją, pažinimą ir AD stadijas, atveriančius kelią tiksliajai medicinai. Mūsų tyrimai yra vilties švyturys tiems, kurie kenčia nuo AD, įkvepiantys mus tęsti nenumaldomą veiklą. siekdami žinių ir pažangos, tikimės pakartoti šiuos rezultatus BIDMC pacientams, sergantiems Alzheimerio liga.