Skrandžio vėžys (GC) yra mirtinas piktybinis navikas, paplitęs visame pasaulyje ir laikomas endeminiu Rytų Azijos, Rytų Europos ir Pietų Amerikos šalyse. Iš tiesų, mano šalyje, Čilėje, GC yra pagrindinė vyrų mirties nuo vėžio priežastis.
Pagrindinė GC problema yra ta, kad ji dažnai aptinkama pažengusiose stadijose, kai jos išgyvenamumas gali būti mažesnis nei 10%. Priešingai, ankstyvųjų GC atvejų išgyvenamumas gali siekti 90%. Tai paskatino naujų ankstyvo ir savalaikio aptikimo metodų poreikį.
Perkeliami elementai (TE), vadinamieji „šokinėjimo genai“, retai tiriami dėl skaičiavimo sunkumų. Nepaisant to, pastaraisiais metais padaugėjo tyrimų, kuriuose daugiausia dėmesio skiriama TE vaidmeniui sergant įvairių tipų vėžiu. Tačiau jų poveikis GC anksčiau nebuvo ištirtas.
Naujausiame mano darbe, dabar paskelbtame m Mokslinės ataskaitossužinojau, kad TE ekspresija yra GC požymis ir kad jų aktyvumas gali būti susietas su piktybinio ar „auglio“ statuso įgijimu.
„Šokančių genų“ pradžiamokslis
Žmogaus genomas yra maždaug 3 milijardų bazių ilgio, tačiau tik apie 1% jo atitinka baltymus koduojančius genus. Priešingai, beveik 50% žmogaus genomo atitinka perkeliamus elementus, kurie yra labai pasikartojantys elementai dėl savo „šokinėjimo“ pobūdžio: TE turi galimybę daugintis ir judėti genome.
Iš pradžių jie buvo vadinami „šiukšlinėmis DNR“ dėl akivaizdaus parazitavimo ir savanaudiškumo, siekiant sukurti daugiau kopijų. Barbara McClintock pradėjo darbą, atskleidžiantį, kad TE vaidina svarbų vaidmenį kontroliuojant genų ekspresiją, ir už šį atradimą jai 1983 m. buvo suteikta Nobelio premija.
Šiandien gerai žinoma, kad TE gali dalyvauti genų reguliavime sveikomis ir ligomis, kaip pranešėme ir daugelis kitų grupių. Tai buvo įmanoma sukūrus skaičiavimo priemones jų studijoms, prie kurios prisidėjome aš ir kelios laboratorijos.
Perkeliami skrandžio vėžio elementai
Savo tyrime pirmiausia panaudojau vienos ląstelės RNR sekos nustatymo duomenis, kad atkurčiau ląstelių evoliuciją nuo normalios iki piktybinės būklės, ir įvertinau, ar TE aktyvacija yra susijusi su tomis „navikinėmis“ ląstelių linijomis. Vėliau, norėdamas patvirtinti ir toliau apibūdinti, kad TE aktyvacija yra GC požymis, aš taip pat įvertinau jų aktyvavimą erdviškai išspręstuose RNR sekos nustatymo duomenyse.
Nors kompiuterinis ląstelių evoliucijos modeliavimas, „trajektorijos išvados“ yra sritis, kurioje daug vystoma, ji nebuvo plačiai taikoma vėžio tyrimams. Derindamas šį metodą su savo patirtimi TE srityje, apibūdinau GC ląstelių evoliuciją ir sužinojau, kad 111 iš šių „šokinėjančių genų“ yra aktyvuoti piktybinių ląstelių linijose.
Kita vertus, turėdami erdviškai išspręstus duomenis, jau matome išraišką audinyje tokį, koks jis yra. Čia aš sužinojau, kad TE yra aktyvuojami tiek naviko regionuose, tiek jų aplinkoje (vadinamojoje naviko mikroaplinkoje). Kai kuriais atvejais netgi sužinojau, kad TE seka perėjimą nuo normalių prie naviko regionų, dar labiau patvirtinant pirmosios tyrimo dalies išvadas.
Kas toliau?
Šie rezultatai yra gana įdomūs ta prasme, kad matome, kad, kaip ir kitų vėžio tipų, TE ekspresija taip pat pasireiškia skrandžio vėžiu. Be to, tai pirmasis tyrimas, kuriame teigiama, kad šie elementai suaktyvėja ankstyvosiose ligos stadijose. Tai rodo, kad šie „šokinėjantys genai“ yra nauji biomarkeriai, skirti laiku aptikti.
Kitas šio tyrimo žingsnis yra eksperimentinis šių išvadų patvirtinimas ir, jei išsiaiškinsime, kad šie elementai nuolat aptinkami ankstyvose stadijose, galime rasti naujų skrandžio vėžio gydymo būdų ir būdų, kaip sustabdyti skrandžio vėžį.
Ši istorija yra „Science X Dialog“ dialogo dalis, kurioje mokslininkai gali pranešti apie savo paskelbtų mokslinių straipsnių išvadas. Apsilankykite šiame puslapyje, kad gautumėte informacijos apie „Science X Dialog“ ir kaip dalyvauti.