Naujas didelio masto atvirų duomenų šaltinis iš Perelmano medicinos mokyklos ir bendradarbių padeda mokslininkams susieti smegenų vystymąsi su psichikos sveikatos sutrikimais.
Psichikos sveikatos sutrikimai, tokie kaip depresija, nerimas ir ADHD, paveikia milijonus žmonių visame pasaulyje ir labai prisideda prie pasaulinės ligų naštos, darydami įtaką žmonių sveikatai ir kasdieniam gyvenimui bei kelia didelę įtampą socialinėms sistemoms ir nacionalinėms bei pasaulio ekonomikoms.
Šios sąlygos dažnai yra susijusios su smegenų vystymosi skirtumais, ypač vaikystėje ir paauglystėje. Tačiau šių smegenų pokyčių, susijusių su psichopatologija – psichikos sveikatos sutrikimų tyrimu, stebėjimą ribojo didelių, įvairių neurovaizdinių duomenų rinkinių poreikis.
Dabar bendradarbiaujanti komanda, vadovaujama Theodore'o D. Satterthwaite'o ir Golia Shafiei iš Perelmano medicinos mokyklos ir Michaelo P. Milhamo iš Vaiko proto instituto, pristato reprodukuojamų smegenų diagramas (RBC), didelio masto atvirų duomenų šaltinį, skirtą smegenų vystymuisi ir jo sąsajoms su psichine sveikata nustatyti. Jų ištekliai paskelbti Neuronas.
„Siekdami sukurti šį didelį duomenų šaltinį, atlikome visus skausmingus, neseksualius dalykus – duomenų organizavimą, vaizdų apdorojimą ir kokybės užtikrinimą“, – sako Satterthwaite'as, McLure II psichiatrijos ir elgesio tyrimų profesorius iš Psichiatrijos departamento ir Penn Lifespan Informatikos ir Neurovaizdavimo centro (PennLINC) direktorius.
RBC integruoja duomenis iš penkių didelių vaikų ir jaunuolių smegenų vystymosi tyrimų trijuose žemynuose ir „suderina“ įvairias jų naudojamas psichinės sveikatos vertinimo priemones. Satterthwaite'as pažymi, kad tokio tipo užduotys yra daug darbo jėgos ir reikalauja skaičiavimo galios, kuri nepatenka į daugelio mokslininkų išteklius. „Iš esmės tai padarėme visiems, todėl jie tiesiog užsiima mokslu ir bėga greičiau.
„Išteklių sudaro daugiau nei 6000 dalyvių smegenų MRT“, – sako Shafiei, Satterthwaite laboratorijos doktorantas. Anksčiau, pasak jos, tyrėjams buvo sunku visapusiškai panaudoti turimus duomenis, kad būtų galima nustatyti smegenų vystymąsi nuo vaikystės iki jauno pilnametystės – iššūkis buvo tas, kad tyrimų metu gauti smegenų skenavimai išleidžiami ir apdorojami skirtingai, todėl juos sunku integruoti.
Taikydami panašų požiūrį į psichinės sveikatos vertinimus, jie suderino psichikos simptomų duomenis, sako Satterthwaite. RBC apima duomenis apie „pagrindines simptomų sritis kiekvienam vaikui, kurio smegenų struktūra ir smegenų funkcija yra matuojami“, – sako jis. Tai leis mokslininkams geriau suprasti, kaip normaliai vystosi smegenys ir kaip psichinės sveikatos simptomų kitimas yra susijęs su smegenų vystymosi skirtumais, priduria jis.
„Mes tiesiog sudėjome juos į vieną patogią vietą kartu su svetaine su paprastomis instrukcijomis, kaip gauti duomenis“, – sako Satterthwaite. „Šis išteklius leidžia labai lengvai pažvelgti į smegenų vystymąsi naudojant didžiulius lengvai naudojamų, neidentifikuotų duomenų pavyzdžius.”
Be didelio naujo atvirų duomenų šaltinio bendruomenei, RBC taip pat siūlo skaidrią ir atkuriamą didelio masto duomenų integravimo ir dalijimosi darbo eigą ir gali būti pavyzdys būsimoms daugiatyrėms pastangoms, kurias kiti gali pritaikyti ar pritaikyti.
„RBC yra svarbus šaltinis, kuriuo galima remtis būsimais tyrimais“, – sako Shafiei. „Jau matome, kad tai pagreitina tyrimus – duomenys buvo atsisiųsti beveik 4000 kartų, nors jie ką tik pasirodė“.